Kegigihannya dalam membangun usaha pun akhirnya berbuah manis. Dia berhasil menarik perhatian Putera Sampoerna, keduanya bertemu pada tahun 1980 dan lima tahun kemudian memutuskan untuk bekerja sama.
Mereka berdua bersepakat untuk membuka 15 kios yang beberapa berlokasi di Jakarta. Kemudian, pada 27 Agustus 1989, berdirilah gerai dengan nama Alfa Toko Gudang Rambat, dan berganti nama menjadi Alfa Minimart pada 1994.
Adapun, setelah Putera Sampoerna menjual bisnis rokoknya ke Philip Morris, Djoko tetap fokus dalam mengembangkan bisnis ritelnya.
Sampai saat ini, Alfamart sudah memiliki lebih dari 16.000 cabang di seluruh Indonesia. Saat ini, Alfamart berada di bawah pengawasan dua anak Djoko yakni, Feny Djoko Susanto sebagai Presiden Komisaris dan Budi Djoko Susanto sebagai Komisaris.