Selain sebagai ekonom, Tony adalah pengajar di UGM Yogyakarta. Dia juga menjabat Direktur Pusat Ekonomi dan Studi Kebijakan Publik di kampusnya.
Tony tercatat pernah menjabat komisaris di Bank Mandiri pada 2003-2005. Dia juga sempat dipercaya menjadi Kepala Ekonom BNI, Komisaris Independen di Permata Bank serta Bank Sumitomo Mitsui Indonesia.
Tony menempuh pendidikan di tempatnya mengajar dan memperoleh gelar doktorandus pada tahun 1986. Selanjutnya pada 1991, Tony meraih gelar Master dari University of Pennsylvania, Philadelpia AS.
Pada tahun 2006, dia mendapatkan Ph.D dari The Australian National University, Australia.