Pihak berwenang Kolombia meluncurkan Operasi Agamemnon tahun 2016 untuk mendekati Otoniel. Operasi ini juga membunuh dan menangkap lusinan pengikut, mengejar keuangan dan memaksanya untuk terus bergerak
Pada tahun 2017, dalam sebuah video, Otoniel mengumumkan niatnya untuk menyerahkan diri ke pengadilan muncul. Tetapi rencana itu tidak pernah membuahkan hasil.
Pada bulan Maret, polisi Kolombia dan Badan Penegakan Narkoba AS menangkap saudara perempuan Otoniel, Nini Johana Usuga. Dia pun diekstradisi ke AS untuk menghadapi tuduhan terkait dengan perdagangan narkoba dan pencucian uang.
Pihak berwenang mengatakan, selain perdagangan narkoba, Clan del Golfo terlibat dengan penambangan ilegal. Pemerintah juga menuduh kelompok itu mengancam dan membunuh para pemimpin masyarakat di seluruh negeri.