Bangunan yang ambruk itu berada di dekat episentrum gempa berkekuatan magnitudo 6,8 dan berada di wilayah yang sama yang dilanda tiga getaran di atas 6,0 dalam hitungan pekan pada Oktober.
Gempa-gempa itu menewaskan sekitar 20 orang dan memaksa puluhan ribu orang mengungsi.
Para petugas berpencar di seluruh wilayah yang terkena gempa di Mindanao untuk menilai kerusakan secara menyeluruh. Beberapa sekolah dan rumah sakit hancur.
Presiden Rodrigo Duterte, yang berasal dari Davao dan ada di sana saat gempa, tidak terluka.
"Ibu negara mengatakan mobil yang dikendarainya bergoyang," kata juru bicara Salvador Panelo.
Filipina berada di lintasan Cincin Api, garis yang terdapat banyak gunung api dan aktivitas seismik, membentang dari Jepang hingga Asia Tenggara serta melingkari Pasifik.
Hal ini menjadi penyebab Filipina kerap dilanda gempa.