Sementara itu tsunami setinggi 80 cm dilaporkan di Prefektur Toyama sekitar pukul 16.35 dan 40 cm juga mencapai Kashiwazaki, Prefektur Niigata, pukul 16.36. Gelombang juga mencapai Pulau Sado di Niigata pada pukul 16.10. Tsunami juga diperkirakan menerjang Yamagata dan Hyogo.
Peringatan tsunami besar yang dikeluarkan untuk wilayah Semenanjung Noto merupakan tingkat tertinggi dari tiga level. Peringatan itu juga setara dengan yang dikeluarkan setelah gempa dahsyat Tohoku pada Maret 2011.
Operator pembangkit listrik tenaga nuklir Tepco sedang memeriksa apakah ada dampak kerusakan akibat gempa pada fasilitasnya di wilayah tersebut.
Namun Tepco mengeluarkan pernyataan pada pukul 16.30 tidak ada keanehan di PLTN di Kashiwazaki, Niigata. Sementara itu guncangan gempa juga terasa di Tokyo dan seluruh wilayah pulau Kanto.