Sebelum itu dia juga memangkas 20.000 pegawai departemen kesehatan sebagai bagian dari efisiensi yang dijalankan Departemen Efisiensi Pemerintah AS (DOGE). Hakim federal Melissa DuBose pada Juli memblokir rencana pemerintah untuk melakukan PHK massal dan reorganisasi besar-besaran di departemen kesehatan.
Sembilan mantan kepala CDC menulis surat terbuka yang diterbitkan pada awal September, menyatakan kebijakan Presiden AS Donald Trump dan pemerintahannya membahayakan kesehatan bangsa.
Surat tersebut mengkritik Kennedy karena memecat petugas kesehatan federal serta menuduhnya berupaya melemahkan program yang dirancang untuk melindungi warga AS dari kanker, serangan jantung, stroke, dan penyakit lainnya.