Indonesia kembali menjabat sebagai sekjen ASEAN dengan masa jabatan dari 17 Juli 1989 hingga 1 Januari 1993 dan diwakili oleh Rusli Noor.
Sekjen ASEAN selanjutnya adalah Dato Ajit Singh wakil dari Malaysia yang menjabat dari 1 Januari 1993 hingga 31 Desember 1997.
Filipina mendapat giliran menjadi sekjen ASEAN yang diwakili oleh Rodolfo C. Severino Jr. dengan masa jabatan dari 1 Januari 1998 hingga 31 Desember 2002.
Ong Keng Yong menjadi sekjen ASEAN yang merupakan wakil dari Singapura dengan masa jabatan dari 1 Januari 2003 hingga 31 Desember 2007.
Surih Pitsuwan merupakan wakil dari Thailand dan menjadi sekjen ASEAN dari 1 Januari 2008 hingga 31 Desember 2012.
Le Luong Minh adalah wakil dari Vietnam yang menjadi sekjen dari 1 Januari 2013 hingga 31 Desember 2017.
Sekjen ASEAN yang kini menjabat adalah Lim Jock Hoi yang merupakan wakil dari Brunei Darussalam dan sudah menjabat sejak 1 Januari 2018 hingga hari ini.