Rute Zonasi adalah rute yang hanya dapat dilalui bus ukuran kecil dengan kapasitas 19 Seat melalui ruas jalan kelas 3 atau di pemukiman padat penduduk.
Rute 1 (Lapangan Banteng - Galur - Perintis Kemerdekaan).
Rute 2 (Plumpang - Sunter - Kemayoran).
Rute 3 (Gandaria - Hek – TMII/Taman Mini Indonesia Indah).
Rute 4 A (Perintis Kemerdekaan - Pulogadung - BOR - Pondok Kopi).
Rute 4 B (Perintis Kemerdekaan - Pulogadung - Pulo Gebang - Pondok Kopi).
Rute 5 (Kampung Melayu - TMII - Ceger).
Rute 6 (Pasar Minggu – Warung Buncit - Kebayoran Baru PTIK).
Rute 7 (Pasar Minggu - Ranco - Lenteng Agung - Universitas Indonesia).
Rute 8 (Pasar Minggu - Pancoran - Manggarai).
Rute 9 (Cilincing - Plumpang – Perintis Kemerdekaan).
Rute 10 (Kampung Melayu - Lapangan Banteng).
Rute 11 (Blok M - Ciledug).
Rute 12 (Terminal Kalideres - Gajah Mada).
Rute 13 (Pulogadung - Pondok Bambu - Kalimalang - Cawang – PGC/Pusat Grosir Cililitan).
Rute 14 (Blok M - Pondok Labu).
Rute 15 (Tebet - Cipinang Muara - Pondok Kopi).
Rute 16 (Rusun Muara Baru Pluit - Grogol).
Rute 17 (Rusun Muara Baru Pluit - Bandengan Muara Angke (Kali Adem)).
Rute 18 (Meruya - Ciledug).
Rute 19 (Bendungan Hilir - Kemanggisan).
Rute 20 (Kemanggisan - Daan Mogot).
Rute 21 (Lodan – Kota Tua – Pinangsia)
Rute 22 (Pasar Minggu – Kebagusan – Pondok Labu)
Rute 23 (Kembangan – Pesanggrahan – Meruya)
Rute 24 (Kemanggisan – Kebayoran Lama – Gandaria)
Rute 25 (Blok M – Rempoa)
Rute 26 (Pulogadung – Cilincing Via Pegangsaan Dua – Semper)
Rute 27 (Tipar Cakung – Sukapura – Semper – Koja)
Rute 28 (Gajahmada – Jembatan 5 – Pinangsia)
Zonasi 1 (Pondok Gede - Condet – Ranco Indah).
Zonasi 2 (Kampung Melayu - Rawamangun).
Zonasi 3 (Terminal Kalideres - Kamal).
Zonasi 4 (Kalideres - Semanan - Duri Kosambi).
Zonasi 5 (Pulogadung - Mardani - Paseban).
Zonasi 6 (Cawang - Ragunan).
Zonasi 7 (Rawamangun - Manggarai - Cikini).
Zonasi 8 (Lubang Buaya - Duku 5 - Kampung Rambutan - Ranco).
Zonasi 9 (Rorotan - Marunda).
Zonasi 10 (Rusunawa - Cilincing).
Zonasi 11 (Rusun Kapuk Muara - Jembatan Lima - Cideng).
Zonasi 12 (Rusun Rawabebek - Cakung Timur - Rorotan).
Zonasi 13 Cipedak – Srengseng Sawah