MRT Jakarta juga menghadirkan program “Free MRT Rides” dan Runners’ Special Lane bagi para peserta. Melalui program ini, peserta terdaftar dapat menikmati empat kali perjalanan MRT gratis, yang dapat digunakan sebanyak dua kali pada 23 atau 24 Oktober 2025 dan dua kali lainnya pada 25 atau 26 Oktober 2025, dengan rute perjalanan menuju dan dari Stasiun Istora Senayan.
Peserta cukup menunjukkan serta memindai QR Code pada email dan BIB resmi di jalur khusus MRT Jakarta. Program ini berlaku mulai 23 hingga 26 Oktober 2025, mencakup perjalanan menuju dan dari Race Expo serta Race Central, dan hanya berlaku untuk rute dari dan menuju Stasiun Istora sesuai jadwal kategori masing-masing pelari.
Selain itu, MRT Jakarta membuka Runners’ Special Lane di beberapa stasiun sebagai jalur prioritas bagi peserta JRF 2025. Fasilitas ini beroperasi pada pukul 11.00-19.00 WIB (23-24 Oktober) dan pukul 03.00-19.00 WIB (25-26 Oktober) untuk mendukung proses pengambilan race pack hingga hari perlombaan.