Lokasi sekolah yang berada dalam kompleks TNI AL Kodamar membuat pihak TNI AL juga turun memberikan dukungan penuh terhadap proses investigasi. TNI AL memastikan akan membantu Polri dalam mengamankan area serta melakukan koordinasi jika ditemukan keterkaitan dengan unsur militer.
Dalam penyelidikan awal, satu orang telah diamankan polisi untuk dimintai keterangan terkait peristiwa ledakan ini. Namun, polisi belum memberikan keterangan resmi mengenai identitas dan peran orang tersebut.
Area SMAN 72 Jakarta kini telah dipasang garis polisi (police line) dan disterilkan sepenuhnya. Puluhan personel bersenjata lengkap dari Brimob dan TNI AL berjaga di sekitar sekolah.