Festival ini berawal dari tantangan Menteri Kelautan dan Perikanan Susi Pudjiastuti kepada Wakil Gubernur DKI Jakarta Sandiaga Uno untuk membersihkan Danau Sunter layaknya Danau Jenewa di Swiss. Tantangan Susi itu pun dijawab Sandi dengan menginisiasi penyelenggaraan festival sebagai bentuk perayaan penataan Danau Sunter.
Berikut kronologi perjalanan ide Festival Danau Sunter.
Tanggal 28 November 2017, Menteri Susi menantang Anies-Sandi untuk menyulap Danau Sunter layaknya Danau Jenewa di Swiss.
Tanggal 29 November 2017, Sandi menerima tantangan Susi.
Tanggal 1 Desember 2017, Sandi mengajak Susi lomba renang di Danau Sunter.
Tanggal 5 Desember 2017, Susi menerima tantangan Sandi asalkan air di Danau Sunter bersih.
Tanggal 4 Januari 2018, Pemerintah Provinsi DKI Jakarta mulai membersihkan air Danau Sunter.
Tanggal 11 Januari 2018, Pemerintah Provinsi DKI Jakarta mulai membersihkan bangunan liar dan menata pedagang kaki lima yang berada di sekitar Danau Sunter.