Kabar mengenai keahlian Sayyid yang bisa menyembuhkan orang sakit pun bahkan sampai terdengar ke telinga Raja Majapahit yang langsung memanggilnya untuk membantu menyembuhkan penyakit sang ratu.
Raja Majapahit pun memberinya sebidang tanah di pinggiran Gresik. Daerah ini sekarang dikenal sebagai Desa Gapura.
Selanjutnya, untuk melanjutkan perjuangan menegakkan ajaran-ajaran Islam, Sunan Gresik membuka pesantren-pesantren yang merupakan tempat mendidik pemuka agama Islam pada masa selanjutnya.
Setelah selesai membangun dan menata pondokan tempat belajar agama di Leran, Syeh Maulana Malik Ibrahim wafat tahun 1419. Makamnya kini terdapat di desa Gapura, Gresik, Jawa Timur.