Dalam periode ini Prof Baedhowi serius memprogram pendidikan unggul atau pendidikan utama Muhammadiyah. Dia selalu rutin memberikan info khusus kepada Ketua Umum PP Muhammadiyah.
“Terakhir menyusun Peta Jalan Pendidikan Muhammadiyah, Pangkalan Data Pendidikan Muhammadiyah, dan Penyelenggaraan Pendidikan Muhammadiyah di masa pandemi dengan pembelajaran daring," katanya.