Kostrad sejak 2001 memiliki satuan khusus bernama Satuan Peleton Intai Tempur yang disingkat Tontaipur. Satuan ini memiliki keahlian khas melakukan infiltrasi ke jantung musuh secara senyap untuk melakukan sabotase, dibekali senjata berupa senapan serbu, pistol, sangkur, dan sniper.
Sementara Kopassus memiliki kemampuan khusus seperti bergerak cepat di setiap medan, menembak dengan tepat, pengintaian, dan antiteror.
Dalam OMP, fungsi Kopassus di antaranya melakukan serangan langsung untuk menghancurkan logistik musuh, Combat SAR, Antiteror, dan Operasi Inteligen Khusus.
Sementara, pasukan Kostrad dalam OMP berfungsi menyelenggarakan operasi gabungan pertahanan udara serta pertahanan pantai, operasi darat berupa operasi serangan, dan sebagainya. Kostrad juga melakukan operasi bantuan untuk pertahanan dan intelijen.
Dalam OMSP, Kopassus berfungsi melakukan bantuan kemanusiaan, AIRSO (yaitu operasi anti insurjensi, separatisme dan pemberontakan), perbantuan terhadap kepolisian/pemerintah, SAR Khusus serta Pengamanan VVIP.
Sementara Kostrad berfungsi melakukan pengamanan objek vital, pengamanan wilayah perbatasan, operasi penaggulangan bencana hingga menghadapi kelompok separatis dan teroris.