Mantan Kapolri Jenderal Listyo Sigit Prabowo kemudian dipercaya mengisi posisi Kepala Staf Kepresidenan (KSP). Posisi tersebut sebelumnya ditempati Dudung Abdurachman.
Di luar jajaran kementerian, Prabowo turut mengubah sejumlah posisi di badan pemerintah. Dedi Prasetyo dilantik sebagai Kepala Badan Reformasi Agraria Nasional (BRAN).
Kemudian Muhammad Fadil Imran dilantik sebagai Wakil Kepala Badan Otorita Pengelola Pantai Utara Jawa (BOPPJ). Badan tersebut merupakan lembaga yang dibentuk untuk mengelola kawasan Pantai Utara Jawa.