Selain itu, Ustaz Yahya Waloni juga pernah dilaporkan oleh Menteri Pelindungan Pekerja Migran Indonesia (P2MI) Abdul Kadir Karding pada tahun 2018 silam
Saat itu, Ustaz Yahya Waloni dilaporkan ke Bareskrim Polri karena isi ceramahnya yang dituding menghina sejumlah tokoh seperti KH Ma'ruf Amin, Megawati Soekarnoputri, dan TGB Zainul Majdi. Isi ceramah tersebut sebelumya ditayangkan di YouTube.
Terlepas dari kasus yang pernah menderanya, namun sang Ustaz tetap dianggap orang mulia dan banyak doa untuknya karena meninggal di tempat yang mulai dan sedang menyampaikan risalah kebaikan.
Rencananya jenazah almarhum diterbangkan ke Jakarta. Saat ini, jenazah almarhum masih disemayamkan di Masjid Darul Falah, Kecamatan Rappocini, Kota Makassar, Sulawesi Selatan, Jumat (6/6/2025).
"Rencananya dimakamkan di Jakarta. Tapi kita menunggu keputusan dari keluarga almarhum," kata Ketua Masjid Darul Falah, Syahruddin Usman.
Ustaz Yahya Waloni meninggal dunia saat sedang menyampaikan khutbah Jumat. Ustaz yang merupakan mualaf tersebut sempat jatuh saat berada di atas mimbar khutbah. sebelum menjadi khatib di Masjid Darul Falah, almarhum didapuk menjadi khatib shalat Idul Adha di Jalan Rajawali Makassar.
"Iya, Ustaz Yahya (Waloni) tadi meninggal dunia saat membawakan Khutbah Jumat," ujarnya.
Syarifuddin mengaku sempat melihat Ustaz Yahya Waloni sempat duduk di mimbar sebelum masuk khutbah kedua.
"Beliau sempat duduk saat khotbah kedua menjelang doa. Tidak lama setelah itu beliau jatuh dan meninggal dunia," tuturnya.