Segara Anakan Cilacap sendiri merupakan laguna raksasa yang merupakan muara dari tiga sungai besar, diantaranya adalah sungai Cikonde, Sungai Citanduy, dan Sungai Cibeureum. Untuk menuju lokasi ini, wisatawan akan menggunakan kapal menuju kampung laut.
4. Gunung Selok
Destinasi wisata di Cilacap selanjutnya adalah Gunung Selok. Gunung Selok berada diketinggian sekitar 150 mdpl. Di lokasi ini banyak ditemukan gua di sekitar Gunung Selok. Setidaknya ada dua gua yang populer, di antaranya adalah Gua Rahayu dan Gua Naga Raja yang berbentuk menyerupai naga.
Selain itu, di atas Gunung Selok terdapat pula padepokan yang bernama Jambe Pitu. Wisatawan juga akan melihat pemandangan alam yang indah, hamparan sawah, laut, dan juga pepohonan rimbun.
5. Benteng Pendem
Benteng Pendem atau Kustbatterij op de Landtong te Tjilatjap merupakan bangunan peninggalan Belanda yang sudah ada sejak tahun 1861. Benteng Pendem sendiri sempat tidak terurus akibat terpendam oleh pasir.
Pada tahun 1986 benteng pendam mulai digali dan mendapatkan perhatian hingga dijadikan sebagai objek wisata Cilacap. Benteng ini buka mulai pukul 08.00 - 18.00 WIB dengan harga tiket masuk berkisar Rp5.000-Rp7.500.