Tak hanya tegas, Kiai Miftah juga terkenal alim dengan penguasaan berbagai ilmu agama. Selain karena lahir di kalangan pesantren, kiai Miftah juga pernah nyantri di sejumlah pondok pesantren di Jatim dan Jawa Tengah. Konon, karena penguasaan ilmu agamanya ini, Kiai Miftah diambil mantu oleh Syekh Masduki Lasem.
Sementara di kalangan NU, Kiai Miftah juga dikenal sebagai ulama yang sangat hormat dengan tamu. Sebagai bentuk penghormatan itu, Kiai Miftah selalu melayani (menyuguhkan) hidangan sendiri untuk tamunya.
Situs NU dan laduni mencatat, Kiai Miftah merupakan putra dari pengasuh Ponpes Tahsinul Akhlaq Rangkah. Kiai Miftah merupakan putra kesembilan dari 13 bersaudara.
Sejak kecil KH Miftachul Akhyar tumbuh dalam didikan ayahandanya, beliau belajar berbagai disiplin ilmu agama kepada ayahnya. Setelah selesai belajar kepada ayahnya, Kiai Miftah melanjutkan belajar ke beberapa pondok pesantren yakni, Pondok Pesantren Tambakberas, Jombang; Pondok Pesantren Rejoso; Ponpes Sidogiri Pasuruan; Pondokpes Lasem, Jawa Tengah.
Selain itu, Kiai Miftah juga pernah nyantri di Majelis Ta'lim Sayyid Muhammad bin Alawi Al-Makki Al-Maliki di Malang, ketika Sayyid Muhammad masih mengajar di Indonesia.
Kini, selain aktif di PBNU, Kiai Miftah juga sibuk mengsuk Ponpes Miftachus Sunnah, Kedung Tarukan, Kota Surabaya. Pondok khusus putri ini diridikan Kiai Miftah di dekat rumah tinggalnya, bekas rumah kakeknya.