Hasil pemeriksaan menunjukkan pesawat Pilatus PC-6/B2-H4 Turbo Porter registrasi PK-RCY mengalami kerusakan akibat kebakaran sekitar 90 persen. Bagian tengah badan pesawat menjadi area dengan kerusakan paling parah.
Dari lokasi kejadian, penyidik mengamankan sejumlah barang bukti, di antaranya bangkai pesawat yang terbakar, sisa abu dan arang, serpihan badan pesawat, serpihan kawat ban pesawat, satu selongsong peluru kaliber 5,56 mm, serta sampel tanah untuk pemeriksaan laboratorium forensik.
Setelah olah TKP, tim kemudian menyisir di sekitar lokasi kejadian. Petugas menemukan sebuah honai yang diduga digunakan sebagai markas kelompok kriminal bersenjata (KKB).
Di lokasi tersebut ditemukan papan bertuliskan "Markas Komando Daerah Militer TPNPB KODAP VII Balinggama". Petugas juga mengamankan berbagai barang bukti, seperti noken, syal bermotif bintang kejora, pakaian loreng, sangkur, parang, senapan angin, perangkat elektronik, kamera, kartu memori, hingga dokumen dan identitas yang diduga berkaitan dengan keanggotaan TPNPB.
Seluruh barang bukti kini diserahkan kepada Tim Identifikasi Polda Papua untuk pemeriksaan laboratorium forensik, forensik digital, dan analisis lanjutan.