Desa di sekitar Danau Sentani mempunyai adat yang berbeda, namun berasal dari beberapa budaya yang sama sebagaimana terlihat dari kepercayaan dan ritual mereka.
Tak hanya menawarkan pesona alam, Danau Sentani juga memiliki spot wisata sejarah. Balai Arkeologi Papua sempat menemukan tiang rumah prasejarah dalam penelitian di perairan Danau Sentani bagian barat, Kampung Doyo Lama, Distrik Waibu, Kabupaten Jayapura,beberapa tahun lalu.
Hanya saja, saat ini Danau Sentani termasuk sebagai salah satu dari 15 danau di Indonesia yang diprioritaskan untuk diselamatkan berdasarkan Perpres Nomor 60 Tahun 2021. Sebab, tingkat erosi, sedimentasi, dan peningkatan lahan kritis di kawasan tersebut tinggi.