KNPB sendiri baru resmi berdiri pada 2009 setelah Ketua Parlemen Rakyat Daerah (PRD) Buktar Tabuni dan Ketua OPM Sebby Sabom ditangkap. Kini organisasi tersebut memiliki akar cabang hingga ke sejumlah daerah di wilayah Papua.
Gerakan separatis yang bergerak lewat jalur politik ini jelas mendukung aksi teroris yang dilakukan KKB. Selain ada sejumlah oknum yang terlibat dalam perjuangan komplotan tersebut, mereka juga aktif menyebarluaskan informasi hoaks.