Pabandya Binkarpers Kopassus, selanjutnya Kapuskopdal Kopassus, dan Dandim 0709/Kebumen Korem 072/Pmk pada 2010 hingga 2011. Setahun memimpin territorial, dia diangkat menjadi Waaspers Kasdivif 2/Kostrad.
Kariernya semakin moncer, dia kemudian diangkat menjadi Danbrigif 13/1 Kostrad, kemudian Asops Kasdam IV/Diponegoro, selanjutnya Danrindam IX/Udayana dan Danrem 064/Maulana Yusuf. Dedikasi dan loyalitasnya dalam menjalankan tugas dan tanggung jawab membuatnya dipromosikan menjadi perwira tinggi (Pati) TNI.
Dia mendapat promosi jabatan menjadi Danmentar Akmil pada periode 2020 hingga 2021. Jabatan ini membuatnya pecah bintang menjadi Brigadir Jenderal (Brigjen) TNI. Setelah setahun menjabat dia dimutasi menjadi Dirum Pussenif Kodiklatad, kemudian Dirsen Pussenif sebelum akhirnya kembali mendapat promosi jabatan dan kenaikan pangkat menjadi Dansecapaad.
Dalam bidang akademisi, Mayjen TNI Windiyatno juga banyak mengenyam pendidikan militer, di antaranya, Sesarcabif, Dik PARA, kemudian Dik Komando A-64 pada 1993. Selain itu, Suslapa pada 2001 dan Dik PARA Utama. Tidak hanya itu, dia juga lulus pendidikan di Sekolah Staf dan Komando Angkatan Darat (Seskoad0 pada 2007 dan Sekolah Staf Komando (Sesko) TNI pada 2016. Termasuk Lembaga Ketahanan Nasional (Lemhannas) RI.