Permainan apik ini terus ditunjukkan Jonatan di gim kedua. Meski sempat tertinggal 0-2 di awal gim kedua, tetapi Jonatan mampu membalikkannya menjadi 10-2
Bahkan di poin ke-10 ini, Jojo sempat membuat publik China terpana dengan defence akrobatik yang diperlihatkan. Interval gim kedua pun Jonatan unggul jauh yakni 11-3.
Permainan menyerang dan defence yang baik membuat Jonatan semakin tak terbendung. Hingga akhirnya Jojo pun memastikan kemenangan gim kedua dengan skor 21-6.
Hasil ini membuat Jonatan menjadi wakil pertama Indonesia yang lolos ke semifinal BAC 2024. Sebelumnya, tunggal putri Indonesia, Gregoria Mariska Tunjung harus tumbang di perempatfinal usai kalah dari Chen Yu Fei asal China.
Pada semifinal, Jonatan akan bertemu wakil tuan rumah, Shi Yu Qi. Unggulan pertama tersebut lolos ke semifinal usai mengandaskan perlawanan Kunlavut Vitidsarn asal Thailand dengan skor 22-20 dan 21-13.