Pada awal gim kedua, pemain rangking lima dunia itu sempat bisa mengimbangi permainan Chou. Meski sempat ketinggalan 0-2 lebih dulu dia bisa menyamakan skor menjadi 3-3.
Sayangnya, Jonatan tak berani bermain menyerang dan cenderung lebih banyak menaikkan shuttlecock. Kondisi itu pun bisa dimanfaatkan dengan baik oleh Chou untuk melancarkan smash-smash silang yang mematikan. Alhasil, bintang Taiwan berusia 33 tahun itu menjauh dengan keunggulan 7-3 dan kemudian menutup interval gim kedua dengan skor 11-4.
Usai rehat, Jojo berusaha keras untuk bangkit dan akhirnya bisa mendapat empat poin beruntun berkat beberapa kesalahan yang dibuat Chou. Pemain berusia 26 tahun itu pun memangkas ketertinggalannya menjadi 8-11. Namun, Chou bisa keluar dari tekanannya dan menjauh lagi dengan keunggulan 16-11.
Tak menyerah begitu saja, Jonatan mengambil inisiatif menyerang lebih dulu dan strategi itu sukses membawanya mendekat di angka 16-17. Sayangnya, pemain kelahiran Jakarta itu kembali lengah di poin kritis sehingga akhirnya kalah 17-21 di gim kedua.