Mendekati akhir sesi, kejutan datang dari Alex Marquez (Gresini Racing). Dengan hanya menyisakan 12 menit di jam sesi, Alex mencatatkan waktu 1 menit 31,600 detik dan sempat memimpin klasemen FP1, menggusur dominasi kakaknya dan pembalap top lainnya.
Namun, kejutan utama justru datang dari Franco Morbidelli. Di lima menit terakhir sesi, rider VR46 itu tampil luar biasa dan merebut posisi teratas dari Alex Marquez dengan waktu fantastis 1 menit 31,342 detik. Dia langsung melesat sebagai yang tercepat.
Hasil FP1 MotoGP San Marino 2025
1. Franco Morbidelli – 1:31,342
2. Fabio Quartararo
3. Fabio Di Giannantonio
4. Alex Marquez
5. Marc Marquez
6. Marco Bezzecchi
7. Francesco Bagnaia
Meski sempat memimpin, Marc Marquez harus puas finis di posisi kelima, sementara sang Bagnaia harus menerima hasil kurang memuaskan di posisi ketujuh.