Pada menit-menit terakhir FP2, Quartararo semakin terpuruk dalam kondisi trek yang basah. Pembalap asal Prancis itu terlihat turun ke posisi ke-10, sedangkan Marquez mampu mempertahankan posisinya.
Di sudut lain, Enea Bastianini (Gresini Ducati) berhasil finis di urutan ketujuh dalam sesi latihan bebas itu. Bastianini gagal merangsek ke zona lima besar, sementara Francesco Bagnaia (Ducati Lenovo) tersungkur di urutan ke-15.
Pada akhirnya, Marquez mampu mencatatkan namanya sebagai yang tercepat di FP2 MotoGP Jepang 2022. The Baby Alien mendapatkan hasil itu setelah mencatatkan waktu 1 menit 55,232 detik.