Memasuki sesi Q2, giliran Marco Bezzecchi yang menunjukkan dominasinya. Pembalap Aprilia itu langsung menggeser Fermin Aldeguer dari puncak klasemen sementara dengan catatan 1 menit 29,396 detik.
Di sisi lain, Marc Marquez kembali mengalami kesulitan. Ia sempat terkunci di posisi ke-10 dan tak kunjung menemukan kecepatan maksimal, meskipun berusaha keras memacu motornya. Nasib sial juga menimpa Fabio Quartararo yang terjatuh dan tak bisa melanjutkan sesi.
Bezzecchi terus mempertajam waktu. Menjelang akhir sesi, rider Italia itu mencatat waktu spektakuler 1 menit 28,832 detik, menjadikannya yang tercepat di sesi kualifikasi MotoGP Indonesia 2025.
Marco Bezzecchi – 1:28,832
Fermin Aldeguer
Raul Fernandez
Pedro Acosta
Fabio Di Giannantonio
Maverick Vinales
Jorge Martin
Enea Bastianini
Marc Marquez
Miguel Oliveira
Dengan hasil ini, Marc Marquez akan memulai balapan dari grid ke-9, posisi yang cukup berat mengingat persaingan ketat di barisan depan. Sementara Francesco Bagnaia, juara dunia MotoGP dua musim lalu, gagal lolos ke Q2 dan akan start dari luar 12 besar—pukulan telak bagi tim Ducati.