Pembalap kelahiran Afrika Selatan itu berhasil melanjutkan performa apiknya pada Q2. Namun, kemudian Johann Zarco (Prima Pramac) dan Francesco Bagnaia (Ducati Lenovo) mampu melesat lebih cepat dari dirinya.
Marquez yang keluar dari Q1 dengan kerja keras, lagi-lagi terjatuh di lintasan favoritnya ini. Pembalap asal Spanyol itu terjatuh di tikungan 13, sama seperti yang terjadi pada Q1.
Marco Bezzecchi (Mooney VR46) juga menjadi korban keganasan lintasan Sachsenring. Murid Valentino Rossi itu terjatuh di tikungan 13, tempat di mana Marquez terjatuh dua kali hari ini.
Dua setengah menit sebelum berakhirnya sesi kualifikasi, Bagnaia sukses melaju kencang dan memimpin barisan dengan waktu 1 menit 22,028 detik. Jack Miller dan Brad Binder melengkapi tiga besar sementara.
Satu menit jelang akhir, posisi terdepan berganti beberapa kali. Namun, Bagnaia akhirnya sukses menjadi yang tercepat dengan Luca Marini dan Jack Miller mengekor di belakangnya.