Jonantan pun terus berusahan bangkit, tetapi justru tertinggal 1-7. Kendati demikian, ia mampu membalikan keasaan menkadi 11-7 di interval gim kedua.
Sementra selepas interval, Jonantan mendapatkan perlawan ketat. Namun, ia masih bisa menjaga keunggulannya menjadi 15-14.
Kendati demikian, Jonatan tak mampu mempertahankan keunggulannya fan membuat skor menjadi imbang 18-18. Sementara Jonatan harus merelakan gim kedua diambil oleh Kidambi dengan skor 18-21.
Sementara pada gim ketiga, Jonatan berhasil memimpin 8-3. Meski lawan bisa mendapatkan poin demi mengejar ketertinggalan, tetapi ia berhasil menjaga leunggilan menjadi 14-12.
Menjelang akhir gim ketiga, Jonatan kehilangan konsentrasi dan membuatnya tertinggal 15-17 dari Kidambi. meski sudah berusaha untuk mendapatkan kemenangan, tetapi Jonatan harus tersingkir dari babal 32 besar Malaysia Open 2023 usai kalah 16-21.