Sampai akhirnya, Marquez harus menjalani operasi usai MotoGP Italia 2022. Operasi tersebut membuatnya harus menepi pada beberapa seri balapan di musim lalu.
The Baby Alien mengaspal kembali pada MotoGP Aragon 2022. Meski habis menjalani operasi, performa Marquez bisa dibilang cukup apik dibanding rider Honda lainnya.
Karena usai lakukan comebacknya itu, dia mampu meraih podium kedua. Tepatnya pada seri balapan di Australia. Meski demikian, secara keseluruhan memang musim 2022 menjadi musim yang suram bagi Marquez karena harus menjalani banyak momen buruk.