Hatrik pertama dibuat pemain 24 tahun ke gawang Borussia Monchengladbach pada 30 Agustus 2019 yang berkesudahan dengan skor 3-1. Sedangkan trigol kedua dicetak ke gawang Mainz di paruh pertama pada 2 November 2019. Di laga tersebut Leipzig menang telak 8-0.
Dengan demikian, Mainz menjadi klub yang paling rajin dibobol Werner musim ini. Total, sudah enam gol digelontorkan Werner ke gawang tim besutan Achim Beierlorzer itu dalam dua pertemuan berturut-turut.
Menariknya, jika diakumulasikan dari dua pertemuan musim ini Leipzig sudah memasukan 13 gol ke gawang Mainz, terbanyak dari laga menghadapi tim-tim lainnya.
Tambahan tiga angka membuat raihan poin Leipzig menjadi 54 dari 27 pertandingan, mereka masih terpaut tujuh poin dari Bayern Munchen di puncak klasemen sementara Bundesliga 2019/2020.