Borneo FC mengambil inisiatif menyerang pada awal babak kedua, tetapi penyelesaian akhir yang kurang sempurna dari Ikhsan Nul Zikrak membuat gawang Persebaya Surabaya masih tetap aman.
Lalu tendangan Bruno Moreira Soares pada menit ke-51 masih belum bisa membuat Bajul Ijo memimpin, setelah Nadeo Arga Winata dengan sigap menjaga gawangnya dari kemasukan gol.
Usaha Andre Oktaviansyah untuk membawa Persebaya Surabaya memimpin pada menit ke-55 masih belum berhasil, setelah umpan dari Robson Carlos Duarte masih belum menemui sasaran. Ikhsan Nul Zikrak kembali mendapatkan peluang untuk membawa Borneo FC memimpin, tetapi tendangannya pada menit ke-64 masih bisa diamankan Andhika Ramadhani.
Pada menit ke-85, Toni Firmansyah berhasil membungkam Borneo FC untuk membawa Persebaya Surabaya memimpin usai tendanganya tak mampu dijangkau Nadeo Arga Winata. Borneo FC pun mencoba untuk menyamakan keadaan, tetapi usia Adam Alis Setyano dan Ahmad Nur Hardianto masih gagal usai keduanya gagal memanfaatkan peluang dengan baik.
Kendati demikian, Muhamad Kasim Botan melakukan kesalahan fatal dan membuat Persebaya Surabaya kebobolan. Dia membuat gol bunuh diri pada menit 90+2 dan membuat Borneo FC menyamakan kedudukan.
Sementara Persebaya Surabaya harus bermain dengan 10 pemain, setelah Paulo Henrique Santos De Azevedo terkena kartu pada menit-menit akhir tambahan waktu babak kedua. Borneo FC pun sukses memanfaatkan keunggulan pemain dan memastikan kemenangan melalui Ikhsan Nul Zikrak pada menit ke-90+8.
Susunan Pemain Borneo FC vs Persebaya Surabaya:
Borneo FC: Nadeo Arga Winata; Leo Guntara, Diego Robbie Michiels, Silverio Junio Goncalves Da Silva, Muhammad Fajar Fathurrahman, Kei Hirose, Adam Alis Setyano, Stefano Jantje Lilipaly, Willem Jan Pluim, Terens Owang Priska Puhiri, Felipe Cadenazzi.
Pelatih: Pieter Huistra.
Persebaya Surabaya: Andhika Ramadhani; Reva Adi Utama, Dusan Stevanovic, Silva Paixao Yan Victor, Arief Catur Pamungkas, Kadek Raditya Maheswara, Muhammad Iqbal, Andre Oktaviansyah, Robson Carlos Duarte, Bruno Moreira Soares, Paulo Henrique Santos De Azevedo.
Pelatih: Paul Munster.