Di pertandingan babak kedua, pelatih Borneo FC menerapkan strategi yang berbeda dari babak pertama. Hal ini terbilang manjur. Laga baru berjalan 4 menit, Muhammad Ariel Mahmud mampu mengubah skor menjadi 2-1.
Unggul jumlah gol tidak membuat determinasi permainan Borneo FC turun, mereka terus menekan dan menguasai bola hingga membuat para pemain PSIS Semarag frustasi.
Menit ke-72 Muhammad Zaki menambah keunggulan bagi Borneo FC. Lewat sepakan keras kaki kanannya dia mampu menggetarkan gawang PSIS Semarang.
Pertandingan terkunci hingga memasuki menit ke-80+1. Lewat aksi Kautsar Taqi. Dia mencuri bola di tengah lapangan, langsung menendang ke arah kanan gawang dan berbuah gol. Borneo FC 4, PSIS Semarang 1.
Tidak ada gol tambahan di sisa laga hingga wasit meniup peluit panjang di menit ke-90+5. Skor 4-1 untuk kemenangan Borneo FC dalam laga Nusantara Open 2022 Piala Prabowo Subianto.