Keegan kemudian melanjutkan karier ke Hamburg di Jerman. Bersama klub Bundesliga tersebut, dia membawa Hamburg menjuarai Bundesliga musim 1978-1979 dan mencapai final Piala Champions Eropa 1980. Penampilan impresifnya juga membuat dia meraih Ballon d'Or secara beruntun pada 1978 dan 1979.
Setelah kembali ke Inggris, Keegan memperkuat Southampton dan Newcastle United hingga pensiun pada 1984. Setahun kemudian, dia sempat kembali bermain sebagai pemain tamu bersama klub Australia, Blacktown City.
Selepas gantung sepatu, Keegan melanjutkan kiprahnya sebagai pelatih. Dia sukses membawa Newcastle United promosi ke kasta tertinggi sepak bola Inggris dan mengantarkan klub finis sebagai runner-up Liga Inggris setelah bersaing ketat dengan Manchester United dalam perebutan gelar.
Keegan juga pernah menangani Fulham, Manchester City, serta dipercaya melatih Timnas Inggris pada 1999 hingga 2000. Dia membawa The Three Lions tampil di Euro 2000 dan memimpin tim pada awal kualifikasi Piala Dunia 2002 sebelum memutuskan mundur dari jabatannya.
Federasi Sepak Bola Inggris (FA) memastikan akan memberikan penghormatan khusus kepada Keegan saat Timnas Inggris menjamu Spanyol di Stadion Wembley pada September mendatang.