Turnamen ini menggunakan fase grup dan sistem gugur. Dari 6 peserta, dibagi menjadi dua grup. Grup A diisi oleh Republic of St. Pauli, Gibraltar, dan Tibet. Sementara Grup B dihuni oleh Siprus Utara, Zanzibar, dan Greenland.
Dari Grup A, St. Pauli dan Gibraltar berhasil melaju ke semifinal. Sementara di Grup B, Siprus Utara dan Zanzibar melaju ke semifinal.
Di babak semifinal, Siprus Utara sukses mengalahkan Gibraltar dengan skor 2-0. Sementara St. Pauli menyerah dari Zanzibar dengan skor 1-2.
Final pun mempertemukan Siprus Utara dan Zanzibar yang berakhir dengan skor kacamata sampai pertandingan berakhir. Laga pun terpaksa dilanjutkan dengan adu penalti dan menghasilkan Siprus Utara sebagai pemenang kejuaraan dengan skor 4-1.
Sepanjang turnamen, ada 33 gol yang tercipta dari 10 pertandingan. Untuk juara ketiga diduduki oleh Gibraltar yang menang 2-1 atas St. Pauli.
Meski turnamen ini mendapat publikasi yang lumayan saat itu, nyatanya kejuaraan FIFI Wild Cup ini sangat sepi penonton. Jumlah penonton yang hadir saat itu rata-rata hanya sekitar 400 orang. Hal itulah yang mungkin membuat FIFI Wild Cup 2006 akhirnya menjadi turnamen pertama dan terakhir yang diselenggarakan.