Karier awal Rizky Pellu dimulai saat dia bermain untuk salah satu pemain di klub lokal Maluku. Kala itu, Rizky Pellu ikut membawa timnya menjuarai Piala Medco U-15 pada tahun 2006.
Kesuksesan tersebut ternyata adalah awal dari karier Rizky Pellu yang mulai merangkak naik. Saat tahun 2008, Rizky Pellu bergabung ke timnas U-17. Menjadi bagian dari tim utama, nama Rizky Pellu semakin dikenal dan terus menanjak.
Hingga pada tahun 2009, Rizky Pellu direkrut untuk bergabung di tim SAD di Uruguay atau Deportivo Indonesia. Di sana, Rizky Pellu semakin mendapat banyak kesempatan untuk menimba ilmu di tim muda tersebut.
Hingga pada tahun 2010l, Rizky Pellu akhirnya kembali ke Indonesia. Dia langsung direkrut oleh klub asal Jawa Tengah, Persis Solo. Dua tahun membela Laskar Sambernyawa, Rizky Pellu mencatatkan 25 penampilan.
Meski tak membukukan gol, penampilan apik Rizky Pellu membuatnya direkrut klub milik Bakrie Group, Pelita Bandung Raya pada pada 2012. Meski saat itu dirinya masih berusia 20 tahun, nyatanya dia mampu tampil cemerlang.
Kemampuannya mengalirkan serangan ke depan dan sering membantu pertahanan mulai terlihat, membuatnya menjadi pemain tengah yang sangat ideal. Rizky Pellu membukukan 60 pertandingan dan mencetak dua gol.
Hingga pada tahun 2015, Rizky Pellu memulai mengembangkan lagi kariernya dengan bergabung bersama Mitra Kukar. Saat itu, Rizky Pellu dikontrak oleh klub asal Kalimantan tersebut selama dua tahun. Tercatat, Rizky Pellu diturunkan sebanyak 32 kali dan mampu mencetak 7 gol dalam semusim.
Sayangnya, sempat terjadi masalah terkait kontrak antara Rizky Pellu dan Mitra Kukar. Hal itu membuat Rizky Pellu akhirnya bergabung dengan PSM Makassar pada tahun 2016. Bersama tim Juku Eja, Rizky Pellu menjadi andalan di lini tengah. Dia bermain lebih dari 116 kali dan mencetak 17 gol dalam rentang waktu 2016-2021.
Mulai 18 Maret 2021, Rizky Pellu akhirnya resmi bergabung dengan klub Serdadu Tridatu, Bali United. Sepanjang musim Liga 1 2021-2022, Rizky Pellu berhasil mencatatkan 1 gol dan 1 assist dalam 22 pertandingan yang dilakoninya.