Benny Dollo kemudian mendapat beberapa periode untuk menangani Timnas Indonesia, yakni 2000-2001, 2008-2010, serta 2015. Ivan Kolev juga mendapatkan lebih dari satu kesempatan, masing-masing pada 2002-2004 dan 2007.
Perjalanan berlanjut bersama Peter Withe pada 2004-2007. Setelah itu, Alfred Riedl menjadi salah satu pelatih yang beberapa kali dipercaya menangani Garuda pada periode 2010-2011, 2014, dan 2016.
Wim Rijsbergen kemudian memimpin Indonesia pada 2011-2012, disusul Nil Maizar pada 2012-2013. Pada 2013, kursi pelatih juga ditempati Rahmad Darmawan dan Jacksen F Tiago.
Luis Milla mengambil alih Timnas Indonesia pada 2017-2018. Selepas era pelatih asal Spanyol tersebut, Bima Sakti menangani Garuda pada 2018 sebelum Simon McMenemy mendapatkan kepercayaan pada 2019 sebelum dipecat dan digantikan sementara oleh Yeyen Tumena.
Shin Tae-yong kemudian memulai periode panjang bersama Timnas Indonesia pada 2020. Pelatih asal Korea Selatan tersebut bertahan hingga 2025 sebelum tongkat kepelatihan beralih kepada Patrick Kluivert pada tahun yang sama.