Memasuki babak kedua, Garuda Muda tetap mempertahankan tekanan. Indonesia langsung memperoleh dua peluang emas melalui Dolvi Solossa dan Dhamar, tetapi keduanya belum berhasil menambah keunggulan.
Dolvi kembali mendapatkan kesempatan pada menit ke-56. Kali ini, dia menyambut umpan silang dengan sundulan, tetapi Nicko Buan berhasil menggagalkan peluang tersebut melalui penyelamatan di bawah mistar Filipina.
Indonesia akhirnya mendapatkan gol ketiga pada menit ke-77. Gol tersebut lahir melalui skema serangan balik cepat yang diselesaikan I Dewa Gede Majesta Sandhya.
Majesta melepaskan tembakan keras menggunakan kaki kiri dari dalam kotak penalti. Bola meluncur masuk ke gawang Filipina dan mengubah kedudukan menjadi 3-0 untuk keunggulan Indonesia.
Garuda Muda masih berusaha menambah gol pada sisa pertandingan. Pemain pengganti Ichiro Akbar mendapatkan peluang pada menit ke-84 melalui tembakan kaki kiri dari dalam kotak penalti.