Pada 1993, Windows 3.0 dan versi berikutnya terjual dengan cepat sebanyak satu juta kopi per bulan, dan hampir 90 persen dari PC di dunia menggunakan sistem operasi Microsoft.
Pada tahun 1995 perusahaan merilis Windows 95 yang untuk pertama kalinya mengintegrasikan MS-DOS dengan Windows dan secara efektif cocok dengan kemudahan penggunaan Mac OS Apple.
Microsoft juga menjadi pemimpin dalam perangkat lunak produktivitas seperti program pengolah kata dan spreadsheet, mengalahkan saingan lama Lotus dan WordPerfect dalam prosesnya.