Meskipun banyak manfaat, namun, kromium juga dapat menyebabkan masalah kesehatan dan lingkungan jika digunakan secara tidak benar atau dalam jumlah yang besar.
Kromium dapat berbahaya jika diinhalasi dalam jumlah besar atau jika terakumulasi dalam jumlah besar dalam tubuh. Inhalasi kromium VI dapat menyebabkan kerusakan paru-paru, serta risiko kanker paru-paru.
Kromium VI juga dapat menyebabkan iritasi kulit dan kerusakan ginjal jika terakumulasi dalam jumlah besar dalam tubuh. Kromium III dianggap lebih aman dibandingkan dengan kromium VI, tetapi masih dapat menyebabkan iritasi kulit jika terpapar dalam jumlah besar.