Namun, tidak seperti kebanyakan objek wisata danau lainnya, ternyata asal-usul, atau penyebab awal dari Danau Linting hingga saat ini masih menjadi misteri bagi para peneliti.
Mengutip akun Instagram @ayodolan pada Senin (4/10/2021), Danau Linting masih termasuk dalam daerah yang keramat, menurut pengakuan warga sekitar.
Di sekitar danau, terdapat kolam air panas kecil yang dianggap sebagai tempat pemandian Putri Hijau pada masa kerajaan terdahulu. Selain itu, di sekitar danau juga terdapat gua yang disebut sebagai gua emas dan perak karena terdapat material berwarna emas dan perak di dinding gua.
Mereka juga memercayai, gua itu dijaga oleh seekor naga yang dulunya dijadikan tempat perkumpulan atau juga disebut dengan jambur, menurut orang Karo.
Entah apakah cerita misteri di Danau Linting itu benar atau tidak, namun hingga saat ini cerita itu menjadi salah satu daya tarik bagi wisatawan yang ingin berkunjung ke sana.