Masjid Raya Bogor seluas 4.057 m2 ini memiliki ruang utama yang luas. Ada balkon di sisi kiri kanan atas ruang utama dengan penopang berwarna keemasan menambah daya tampung masjid terbesar di Kota Bogor ini.
Langit-langit di bawah balkon dihiasi ornamen berbentuk bintang segi delapan, dengan lampu-lampu tanam. Tembok dinding pada kiri kanan dan atas mihrab dilapis bahan semen fiber-glass yang disebut GRC Board, berhiaskan kaligrafi huruf Arab berisi petikan ayat-ayat Alquran serta ornamen lengkung dan garis.
Di atas lubang mihrab terdapat tulisan Arab berbunyi “Allah” dan “Muhammad” dengan dua baris kaligrafi mendatar di atasnya, dan diapit sepasang kaligrafi melingkar di kiri kanannya.
Tempat imam dan mimbar khatib menjadi satu dengan bagian atasnya berhias ukiran yang menarik. Satu hal menarik lainnya adalah keberadaan bangunan menara yang letaknya terpisah lumayan jauh dari bangunan utama masjid.
Menara yang berdiri cukup jauh dari bangunan utama terkesan seperti bangunan mandiri, jika saja tidak ada lorong penghubung di antara kedua bangunan itu.