Tempat ini dibangun pada masa Hamengkubuwono I (1755-1792) dan diteruskan oleh Hamengkubuwono II (1792-1828). Adapun tujuan dari pembangunan tempat ini adalah sebagai tempat peristirahatan para raja sekaligus tempat pertahanan atau dijadikan sebagai benteng. Situs Warungboto memiliki luasan wilayah yang lebih besar dari situs Taman Sari, yang merupakan pesanggrahan terdekat dari Yogyakarta.
Selain bangunan yang memiliki sejarah, tempat ini memiliki arsitektur yang menarik dan unik seperti penataan pintu dengan bentuk melengkung, jendela dengan bentuk kotak dan minimalis, dan juga penataan tangga-tangganya. Bagian utama dari Warungboto adalah ruang depan, dan kolam. Warungboto tidak dibangun dekat dengan kraton atau Taman Sari dikarenakan Hamengkubuwono I menemukan umbul atau sumber mata air.
Kemudian, dia juga ingin menjadikan tempat ini untuk mendapatkan ruang yang lebih tertutup atau private untuk bermeditasi dan rileks jauh dari hiruk pikuk keraton dan menghabiskan waktu bersama keluarga.
Untuk menikmati kemegahan arsitektur Warungboto, pengunjung yang datang tidak dikenakan tiket masuk. Cukup tidak merusak bangunan bersejarah ini saja. Warungboto buka setiap hari pukul 08.00 WIB - 17.00 WIB.
Situs Warungboto berlokasi di Jalan Veteran No.77, Kelurahan Warungboto, Kecamatan Umbulharjo, Kota Yogyakarta, Provinsi Daerah Istimewa Yogyakarta.
Situs Warungboto berada di antara dua kelurahan dan dua kecamatan yaitu Kelurahan Warungboto Kecamatan Umbulharjo dan Kelurahan Rajawinangun Kecamatan Kotagede.
Adapun rute untuk menuju ke situs ini Anda hanya membutuhkan waktu sekitar 15 menit dari pusat kota Yogyakarta. Anda bisa mengambil jalur selatan melalui Jalan Margo Utomo kemudian lanjut ke Jalan Mataram. Sampai di perempatan pertama setelah Jalan Mataram belok ke kiri menuju ke Jalan Juminahan. Setelah itu, lanjut ke Jalan Ki Mangunsarko sampai bertemu pertigaan kemudian belok ke kiri melewati Jalan Kusumanegara.
Kemudian, lanjutkan perjalanan sampai perempatan dengan bangunan pabrik di sisi kiri. Lalu belok ke Jalan Veteran dan lokasi Situs Warungboto tidak jauh dari situ.