Setelah lulus kuliah, Khan dipromosikan menjadi Direktur Teknik di perusahaan tersebut. Kemudian, pada 1978 dia mendirikan Bumper Works, produsen pembuat bumper mobil untuk truk pikap dengan modal 16.000 dolar AS dari tabungannya.
Khan mencari pinjaman modal sebesar 50.000 dolar AS dari Small Business Administration untuk mengembangkan bisnisnya. Usahanya pun dalam waktu singkat melesat dan makin terkenal.
Kemudian pada 1980, Khan membeli perusahaan Flex-N-Gate, dan dalam waktu sembilan tahun berhasil menjadi satu-satunya pemasok untuk seluruh lini Toyota di Negeri Paman Sam.
Selain bidang otomotif, Khan juga terjun ke dunia olahraga dengan membeli salah satu tim National Football League (NFL), Jaguar Jacksonville dari Wayne Weavers pada 2011. Kesepakatan akuisisi tersebut terjadi pada tahun yang sama dan penjualan rampung pada tahun berikutnya.
Setelah membeli Jaguar Jacksonville, Khan membeli klub Premier League, Fulham FC dari pemilik sebelumnya Mohamed Al Fayed pada 2013 dengan perkiraan harga 150-200 juta euro. Selain sepak bola, Khan diketahui menjadi investor utama di balik gulat profesional All Elite Wrestling (AEW).