Tahun 1999 menjadi tahun di mana karier Pahala semakin baik dengan bergabung ke Booz Allen Hamilton sebagai konsultan senior. Pada tahun yang sama, dia juga beberapa pemimpin proyek perbankan di Asia Tenggara yang dilakukan oleh Boston Consulting Group.
Pada kurun waktu 2003-2006, PT Bank Mandiri (Persero) Tbk lalu merekrutnya dan dia berganti-ganti posisi sebagai group head corporate development lalu pindah ke divisi change management office, divisi accounting, dan divisi economic research.
Pada 2006, dia diangkat menjadi EVP Coordinator Finance & Strategy and Chief Financial Officer. Pada 2017, Pahala dijadikan direktur utama Garuda Indonesia melalui Rapat Pemegang Saham (RUPS). Pada 11 September 2018, Pahala meninggalkan jabatan Direktur Utama Garuda dan digantikan oleh Ari Askhara.
Dia lalu dipindahkan sebagai Direktur Keuangan Pertamina di bawah Direktur Utama Nicke Widyawati. Setahun kemudian, dia diangkat oleh Menteri BUMN Erick Thohir menjadi direktur utama BTN.