Meski begitu, ada efek samping setelah vaksinasi yaitu nyeri di area suntikkan. Pada beberapa kasus, selang 15 menit akan muncul rasa nyeri. Karena itu disarankan untuk beristirahat setelah vaksinasi.
Sebagai informasi, vaksin HPV tidak hanya efektif mencegah kanker serviks, tapi juga mencegah kutil kelamin hingga perlindungan dari infeksi HPV lainnya.