Sebelum akhirnya menikah, perjalanan cinta Bella Saphira dengan sang suami ternyata tidak berjalan mulus karena perbedaan agama. Sebagaimana yang telah diketahui, Bella Saphira dulunya menganut agama Kristen, sedangkan sang suami merupakan seorang muslim.
Bella Saphira juga sempat berpindah agama sebelum menikah. Ia mengucapkan 2 kalimat syahadat di Masjid Istiqlal.
Karena hal itulah, ayah Bella Saphira yang merupakan Ketua Majelis di gereja HKBP dan ibundanya sempat tak merestui pernikahan putrinya tersebut. Bahkan pernikahan Bella Saphira dan Agus Surya Bakti tidak dihadiri oleh pihak keluarga mempelai putri.
Meskipun demikian, hubungan antara Bella Saphira dan kedua orangtuanya tetap terjalin dengan baik. Ia beberapa kali terlihat mengunggah potret kebersamaan dengan ayah dan ibunya di laman media sosial pribadinya.