Wawan bukan berasal dari keluarga sembarangan, ayahnya adalah seorang guru besar di Fakultas Ekonomi Universitas Airlangga Surabaya yang bernama Soedjono Abipraja, sementara ibunya bernama Sulistyaningsih.
Wawan diketahui beragama Islam dan memiliki hobi bermusik dan juga travelling. Pada 1998, Wawan menikah dengan Inge Indrawati.
Dari pernikahan tersebut mereka dikaruniai tiga orang putra dan putri yang bernama Syammakh Islamay Istya Putra, Naifah Uzlah, dan Siti Nurhaliza. Namun hubungan mereka kandas pada 2021.
Beberapa tahun setelahnya tepat pada 19 Juni 2023, Wawan Juniarso kembali menikah dengan seorang notaris asal Bali bernama Ida Ayu Ratih Purnamasari, yang merupakan janda dengan dua anak. Anaknya bernama Adam Bagus Rahmat Ramadan dan Rizqy Bagus Bramadi.
Wawan juga sangat aktif di media sosial (medsos) seperti Instagram @wa2n_juniarso yang memiliki 15,9 ribu followers dan juga kanal YouTube Wawan Juniarso Channel dengan 25,7 ribu subscribers.
Wawan Juniarso mengenyam pendidikan dasar hingga kuliah di Surabaya. Dia merupakan lulusan SD Negeri Pucang Jajar 1 Surabaya, melanjutkan ke SMP Negeri 6 Surabaya lalu ke SMA Negeri 2 Surabaya.