Tengku Zulkarnain dikabarkan positif Covid-19 sejak 2 Mei 2021. Dia diketahui sempat berkeliling Riau untuk mengaji dan berdakwah.
Keterangan positif Covid-19 didapat setelah Tengku Zulkarnian menjalani tes swab PCR di RS Tabrani untuk keperluan perjalanan. Dia harus menjalani tes karena akan terbang ke Medan. Lewat tes itulah dia diketahui positif Covid-19.