Kuatnya ledakan memicu kolom asap di langit dan di sekitar pangkalan militer.
Menteri Luar Negeri Spanyol Arancha Gonzalez Laya menyampaikan keprihatinan melalui cuitan.
"Menyusul perkembangan Guinea Khatulistiwa yang memprihatinkan pascaledakan di Kota Bata," kata Gonzales Laya, dikutip dari Reuters.
Kedutaan Besar Spanyol di Malabo meminta warganya untuk tetap tinggal di rumah.